При пикировке обрывается до 50% корней. В результате из-за остановки в росте удлиняется срок выращивания рассады в среднем на 10 дней или больше при неблагоприятных условиях укоренения сеянцев.

Вредное действие пикировки уменьшается при использовании молодых сеянцев в фазе семядолей и начале появления первого настоящего листа.

В этот период происходит массовое образование корневых бугорков, которые не повреждаются при выборке сеянцев и быстро восстанавливают утраченную часть главного корня за счёт боковых ответвлений.

Пикировка сеянцев с развитыми одним или двумя настоящими листьями связана со значительной потерей не только центрального, но и боковых корней. Нарушение в соотношении надземной части и корневой системы приводит к большой задержке в росте и в конечном итоге ухудшает качество рассады. Молодые, не застарелые сеянцы уже через сутки образуют отдельные новые корешки. Кроме того, у разных растений неодинаковая способность восстанавливать утраченную корневую систему.

В результате пикировки растения образуют мочковатую корневую систему, которая положительно влияет на последующее их развитие в условиях достаточного увлажнения верхних горизонтов почвы и вредит в засушливых условиях, где необходимы хорошо развитые центральные корни, чтобы брать влагу из глубинных слоёв. Вместе с тем пикировка уменьшает вредное действие вытягивания растений за счёт погружения подсемядольной части стебля в почву при пересадке, позволяет лучше, чем при посеве, распределить рассаду на площади, отбраковать все больные, повреждённые, недоразвитые сеянцы и уменьшить в несколько раз расход семян.

Важно также знать, сколько дней составляет  период от всходов до пикировки. В зависимости от условий для капусты он обычно длиться 10…14 дней, томата 20….30 дней, сельдерея 30….35 дней, огурца 7…8 дней. Вообще  пикировка целесообразна в том случае, если допикировочный период больше 8…10 дней.